Tenía curiosidad por la respuesta a su pregunta, así que miré a Rome2Rio: http://www.rome2rio.com/s/Marseille/Chartres.
Pasando por su informe (y no lo he comprobado de forma independiente, que siempre es importante), parece casi un lavado, en el tiempo, entre el tren a toda la manera, y volando a Orly (que no es sólo más cerca de Chartres Que CDG, pero tiene vuelos más frecuentes de Marsella). Tiempo aparte, puede ver todos los pasos involucrados con cada método.
Yo encontraría el tren menos estresante, y con la compra anticipada no debería ser demasiado caro. Si bien Rome2Rio es ideal para rutas, no muestra descuentos disponibles, por lo tanto verifica los precios directamente en Skyscanner https://www.skyscanner.com/ para vuelos y SNCF http://es.voyages-sncf.com/es/ o Captain Train https://www.captaintrain.com/en para los trenes. En SNCF, no se deje redirigir a Rail Europe y elija Francia como su país de recogida de billetes.